Doublet 检测 + 轨迹推断(09-10)

09 — DoubletFinder 双细胞检测

DoubletFinder 通过模拟人工双细胞,识别真实样本中可能的双细胞污染。

Doublet UMAP

UMAP 上标注的 Doublet 细胞

UMAP 上标注的 Doublet 细胞

Doublet 小提琴图

Singlet vs Doublet QC 指标对比

Singlet vs Doublet QC 指标对比

10 — Monocle3 拟时序

对 Fibroblasts 和 Macrophages 两个核心创面修复细胞类型分别做 Monocle3 拟时序分析。

Fibroblasts 轨迹

Fibroblasts Monocle3 拟时序轨迹(按组分图)

Fibroblasts Monocle3 拟时序轨迹(按组分图)

Macrophages 轨迹

Macrophages Monocle3 拟时序轨迹(按组分图)

Macrophages Monocle3 拟时序轨迹(按组分图)
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