亚群分析(14, 17)
对重点亚群进行重聚类(14),识别 Disease 富集的细胞状态;并通过 Pseudobulk + 样本相关性(17)评估生物学重复一致性。
14 — 重聚类与 Disease 富集亚群
去除潜在污染(其他细胞类型 marker 阳性的 cluster)后重聚类,比较各亚群在 Control / Disease 的占比,识别 Disease 中富集的状态。
亚群 marker 基因
Disease 富集亚群 vs 其他亚群 DEG
Disease 富集亚群 GO 富集
17 — Pseudobulk + 样本一致性
每个样本聚合为一个 pseudobulk profile,计算 Pearson 相关性,验证生物学重复一致性 + 组间差异。


