# 功能态打分（19）

通过预定义的小鼠免疫/炎症功能模块基因集，使用 `Seurat::AddModuleScore` 对每个细胞打分，量化不同功能状态在 Control vs Disease 之间的差异。

## 19.1 — 功能模块定义

7 个模块涵盖炎症、应激、修复三大类生物学过程：

模块 | 含义 | 代表基因
--- | --- | ---
Proinflammatory | 促炎反应 | Il1b, Tnf, Il6, Cxcl1/2, Ccl3/4, Nos2
Anti_inflammatory | 抗炎/调节 | Tgfb1, Il10, Arg1, Cd274, Socs3, Mrc1
Oxidative_Stress | 氧化应激 | Sod1/2, Cat, Gpx1, Nfe2l2, Hmox1
Apoptosis | 细胞死亡 | Bax, Bcl2, Casp3, Casp1, Ripk3, Mlkl
ECM_Remodeling | 基质重塑 | Mmp2/9, Col1a1, Col3a1, Fn1, Timp1
Proliferation | 增殖 | Mki67, Top2a, Pcna, Stmn1, Cdk1
IFN_Response | 干扰素应答 | Isg15, Ifit1/2/3, Rsad2, Irf7, Stat1

## 19.2 — UMAP 上的功能得分

各功能模块在 UMAP 上的细胞级评分（多页）

## 19.3 — 组间比较（Violin）

Control vs Disease 各模块得分分布对比

## 19.4 — 各亚群得分热图

重聚类亚群 × 功能模块平均得分（z-score）

## 19.5 — 统计检验

每个模块在 Control vs Disease 间做 Wilcoxon 检验，BH 矫正得 p_adj。

📂 本节相关产出文件

数据

- 19_function_scored.rds — 含所有模块得分的 Seurat 对象 | 在线下载 | 本地查看
- 19_Functional_GeneSet_Definition.csv — 基因集定义 | 在线下载 | 本地查看
- 19_FunctionalScore_Statistics.csv — 组间统计 | 在线下载 | 本地查看

图（PDF 高清版）

- 19_FunctionalScore_UMAP.pdf
- 19_FunctionalScore_Group_Violin.pdf
- 19_FunctionalScore_Cluster_Heatmap.pdf