# 轨迹推断（10-11）

使用 Monocle3 对重点亚群进行拟时序分析，识别细胞分化/激活轨迹与驱动基因。

## 10 — Monocle3 轨迹

Monocle3 拟时序轨迹（按 cluster 着色）+ 拟时序梯度

Control vs Disease 拟时序分布对比

## 11 — 拟时序驱动基因

通过 `graph_test`（Moran’s I）识别沿轨迹显著变化的基因。

拟时序驱动基因表达模式
📂 本节相关产出文件

数据

- 10_monocle3_cds.rds — Monocle3 cell_data_set 对象 | 在线下载 | 本地查看
- 11_Pseudotime_Genes_Statistics.csv — 拟时序驱动基因统计 | 在线下载 | 本地查看

图（PDF 高清版）

- 10_Monocle3_Trajectory.pdf
- 10_Trajectory_Split.pdf
- 11_Pseudotime_Genes.pdf