QC + 注释(01-03)

本章涵盖质控过滤、降维聚类和细胞类型注释。

01 — 质控

QC 小提琴图

QC 指标分布(nFeature, nCount, percent.mt)

QC 指标分布(nFeature, nCount, percent.mt)

QC 散点图

nCount vs nFeature / percent.mt 散点

nCount vs nFeature / percent.mt 散点

02 — 降维聚类

UMAP(按聚类着色)

UMAP 聚类结果

UMAP 聚类结果

UMAP(按组着色)

UMAP 按 Control / Treatment 着色

UMAP 按 Control / Treatment 着色

UMAP(按样本着色)

UMAP 按样本着色

UMAP 按样本着色

03 — SingleR 细胞类型注释

UMAP 按 SingleR 注释细胞类型着色

UMAP 按 SingleR 注释细胞类型着色
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