| ionmode | total_features | after_filter | removed |
|---|---|---|---|
| pos | 8456 | 8456 | 0 |
| neg | 8156 | 8156 | 0 |
血清：概览
基本信息
- 矩阵：血清（serum）
- vendor 批次：biodeep
FD20251000020 - 样本数：17（Con 7 + Dep 10，不对称）
- 离子模式：正离子 (pos) + 负离子 (neg)
警告
7v10 不对称提示
血清比粪便缺 C8/C9/C10 三只对照组小鼠。Welch t 检验、ropls OPLS-DA 都原生支持不对称样本，但要注意：
- Con 组方差估计不确定性更大，P 值偏保守
- 小样本组合下 Q² 容易偏乐观，置换检验是关键校验
- 跨矩阵直接比较 DEM 数量有偏差，建议看效应量（Cohen’s d）排名而非纯计数
特征量统计
血清比粪便特征数少（pos 8456 vs 粪便 21693）——血清代谢物结构更聚焦，符合生物学预期（血液经过肝/肾过滤）。
QC 指标分布
分析摘要
| 阶段 | pos 输出 | neg 输出 |
|---|---|---|
| Peak features | 8,456 | 8,156 |
| t 检验 P<0.05 | 1,310 | 2,507 |
| FDR<0.05 | 220 | 1,519 |
| 三阈值 DEM (P<0.05 & VIP>1 & |log2FC|>1) | 612 | 1,548 |
| 含 MS2 鉴定的 DEM | 60 | 181 |
| 含 KEGG ID 的 DEM | 28 | 86 |
提示
关键观察：血清 neg 模式 DEM 中 Down 占 79%（1226/1548），暗示抑郁组血清大量代谢物浓度系统性下降。这种”广泛下调”现象在抑郁血清代谢组学文献中是常见模式。
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📂 本节相关产出文件
质控与清洗矩阵（TSV）
- qc_summary.tsv — pos/neg 特征数、过滤前后对比 | 在线下载 | 本地查看
- pos_qc_metrics.tsv — 每特征的 missing_rate / RSD / detection_freq（pos） | 在线下载 | 本地查看
- neg_qc_metrics.tsv — 同上（neg） | 在线下载 | 本地查看
- pos_matrix_clean.tsv — pos 清洗后的特征 × 样本矩阵（缺失填充） | 在线下载 | 本地查看
- neg_matrix_clean.tsv — neg 清洗后的特征 × 样本矩阵 | 在线下载 | 本地查看
- pos_matrix_raw_filtered.tsv — pos 仅过滤未填充的矩阵（保留 NA） | 在线下载 | 本地查看
- neg_matrix_raw_filtered.tsv — 同上（neg） | 在线下载 | 本地查看