功能态打分（19）
本章涵盖中性粒细胞功能态分析的完整流程（19.1–19.9）：基因集定义 → Module Score 打分 → 可视化 → DEG 映射 → 通路匹配 → 候选 Marker 排序。
19.1-19.2 — 功能基因集定义 + Pseudobulk 验证
定义 8 个功能状态模块的基因集，并通过 pseudobulk 和单细胞层面验证基因表达。
功能模块定义
Pseudobulk 验证
单细胞层面验证
火山图
19.3-19.4 — Module Score 计算
对每个细胞计算 8 个功能模块的 AddModuleScore，按 cluster / group / sample 汇总。
功能态可视化
Wilcoxon 统计检验
19.6 — DEG 标准化整理
19.7 — DEG × 功能模块映射
19.8 — DEG × 通路映射
19.9 — 候选功能 Marker 排序
三层证据整合：DEG 显著性 + 功能模块归属 + 通路支持数 → A/B/C/D 四级排序。
📂 本节相关产出文件
统计表（CSV）
- 19_Functional_GeneSet_Definition.csv — 功能基因集定义 | 在线下载 | 本地查看
- 19_GeneSet_Availability.csv — 基因集可用性检查 | 在线下载 | 本地查看
- 19_ModuleScore_by_Cluster_Group_long.csv — Module Score 汇总 | 在线下载 | 本地查看
- 19_3_Violin_Wilcoxon_Stats.csv — Wilcoxon 检验 | 在线下载 | 本地查看
- 19_All_DEG_Standardized.csv — 标准化 DEG 全表 | 在线下载 | 本地查看
- 19_DEG_FunctionalState_Mapping.csv — DEG × 功能模块映射 | 在线下载 | 本地查看
- 19_DEG_Pathway_Mapping.csv — DEG × 通路映射（58 MB） | 在线下载 | 本地查看
- 19_Gene_Pathway_Expanded.csv — 基因-通路展开表（28 MB） | 在线下载 | 本地查看
- 19_Candidate_Functional_Markers.csv — 候选 Marker 排序 | 在线下载 | 本地查看
- 19_Candidate_Functional_Markers_Summary.csv — Marker 汇总 | 在线下载 | 本地查看
图（PDF 高清版）
- 19_2_Pseudobulk_Heatmap.pdf
- 19_2_Pseudobulk_vs_SingleCell_Scatter.pdf
- 19_2_SingleCell_DotPlot.pdf
- 19_2_SingleCell_Violin_KeyGenes.pdf
- 19_2_Volcano_AllComparisons.pdf
- 19_FunctionalScore_ClusterGroup_Dotplot.pdf
- 19_FunctionalScore_Cluster_Heatmap.pdf
- 19_FunctionalScore_Group_Violin.pdf
- 19_FunctionalScore_UMAP.pdf