亚群分析(14-16)
本章涵盖中性粒细胞重聚类(14)、亚型 GO/KEGG(15)和 GSEA(16)。
14 — 中性粒细胞重聚类
从 04 的中性粒子集出发,去除混入的 T 细胞(Cluster 5)和 B 细胞(Cluster 6),对剩余细胞重新聚类,得到 4 个功能亚群:
| 亚群 | 命名 | 特征 |
|---|---|---|
| C0 | Immature | 未成熟中性粒,低促炎基因 |
| C1 | IFNγ-Active | IFN-γ 响应激活态 |
| C2 | NETs-prone | NETosis 倾向 |
| C3 | Death/Apoptotic | 凋亡/死亡态 |
Top 20 Marker 热图
15 — 亚型 GO/KEGG 富集
对每个亚群的 marker 基因分别做 GO 和 KEGG 富集,揭示各亚群的功能特征。
16 — GSEA 分析
对各亚群在 Disease vs Control 对比下做 GSEA(Gene Set Enrichment Analysis),识别组间差异通路。
Disease 组在 C1 (IFNγ-Active) 亚群中 NF-κB、TNF 信号通路显著富集;C0 (Immature) 亚群在 Disease 组比例升高。




















